El departamento cuenta con las academias de Química, Ciencia y tecnología de la madera; Biotecnología, y Celulosa y papel; así como un grupo en desarrollo de Manejo forestal. Tiene adscrita la maestría en Ciencia de Productos forestales, programa reconocido por el Conacyt y la especialidad en celulosa y papel que pertenece a la licenciatura en Ingeniería Química adscrita al CUCEI, además de que apoya la licenciatura en Agronomía, del Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias (CUCBA).